1993年公司获批中药学一级学科硕士点，1995年开始在中药学硕士点招收药理学培养方向的硕士研究生，在此基础上，2012年，药理学作为药学二级学科硕士点批准招生。本学科通过整合校内TapTap点点、中西医结合临床公司、公司科研实验中心、省中医院药学部等部门的资源，形成了一支结构合理、学风端正、团结合作和富有创新精神的学术团体。

药理学硕士点主要有以下研究方向：心脑血管药理研究、抗肿瘤药理研究、生殖-内分泌及代谢药理研究、神经精神药理学研究、抗炎免疫药理研究等。本学科先后主持国家新药创制重大专项、国家科技支撑计划、国家自然科学基金等国家级以及省部级科研项目，获得安徽省科学技术进步奖一、二、三等奖。

现有校内外指导老师20人，其中教授19人、副教授6人，具有博士学位的19人。拥有整体生理学实验室、离体器官实验室、生物化学室、细胞培养室、分子药理学研究室、血液流变学研究室、动物行为学研究室、生化分析室、病理室等，配备较为先进的仪器设备。